公司内设综合办公室、计划财务科、人力资源科、营运服务科、安全保卫科、信息技术科、机务保障科等7个职能科室，下设一车队、二车队和修理厂等3个营运生产、维修保障单位。

2017年完成公交回归国有改制以来，公司在市委、市政府、市交通运输局的关心和支持下，在集团（总）公司的直接领导下，基础设施投入不断加大，内部改革不断深化，管理水平大幅提高。公司采取多种措施提高安全服务能力，不仅保障了市民日常出行，而且圆满完成了政府临时安排的各项运送任务。

近年来，巢湖市政府不断加大对公交基础设施投入，一是新建了沐桥、水泥厂、吕婆店、茶厂、前进路等5座公交首末站，并对健康园小区公交首末站进行改建，改善了公交车停靠和驾驶员休息环境，消除了安全隐患。二是在巢湖路、健康路新建了47座具有地方特色的“巢”字型公交候车亭及电子站牌，方便了乘客实时掌握公交车到站信息，改善了市民候车环境。三是2021年年初，公司新购了新型新能源纯电动空调车50辆，使公司新能源公交车总量达到188辆，占运营车辆总数的79%，向绿色低碳出行目标迈出了坚实的一步。50辆纯电动车投入运营，极大地提高了市民乘车舒适度。6个公交首末站的新建和改建，47座公交候车亭及电子站牌的新建，188辆新型新能源公交车的投入运营，迅速改变了公交基础设施落后面貌，增强了公交综合服务能力，提升了城市形象。公司目前正在进行公交智能化系统改造，致力打造智慧公交。

公司积极参与巢湖市“全国文明城市”创建工作，推行星级驾驶员考评工作，不断提升员工素质和服务质量。公司狠抓内控管理，努力降低经营成本，同时健全安全生产、营运管理、机务保障等绩效考核机制，调动员工工作积极性。公司重视党群工作，不断加强党风廉政和精神文明建设，充分发挥党组织在国有企业中的核心和领导作用。

通过全体员工努力，公司近年来获得巢湖市“平安企业”、“A级纳税信用单位”、“劳动保障诚信A级企业”、“劳动保障诚信示范单位”、“巢湖市缴纳社会保险费先进单位”、“合肥市五一劳动奖状”、“合肥市劳动保障诚信示范单位”等称号，涌现出合肥市“工人先锋号”车组、合肥市“敬老文明号”车组、巢湖市“敬老文明号”车组、巢湖市“巾帼文明岗”班组、巢湖市“青年文明号”车组，以及安徽省“劳动模范”、合肥市“劳动模范”、巢湖市“五一劳动奖章”、巢湖市“三八红旗手”等一批先进班组和个人。